MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015942	ATT	2	6	2563473	2563478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015942	CCG	2	6	2563818	2563823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_015942	A	7	7	2563852	2563858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015942	CCAA	2	8	2563900	2563907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_015942	TAA	2	6	2565064	2565069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015942	CAG	2	6	2565125	2565130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_015942	GCAA	2	8	2565550	2565557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_015942	AGA	3	9	2568378	2568386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_015942	CAC	2	6	2568410	2568415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_015942	T	6	6	2568420	2568425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015942	AAC	2	6	2568426	2568431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_015942	TGTAC	2	10	2568537	2568546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_015942	ATC	2	6	2568556	2568561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_015942	TAT	2	6	2568584	2568589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015942	CTT	2	6	2569598	2569603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015942	GTCC	2	8	2569604	2569611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_015942	AGG	2	6	2569636	2569641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015942	CTT	2	6	2569643	2569648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_015942	GAA	2	6	2569661	2569666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015942	TTGT	2	8	2569745	2569752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015942	GAG	2	6	2569769	2569774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015942	ACT	2	6	2571796	2571801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015942	TTA	2	6	2572097	2572102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015942	TGA	2	6	2573020	2573025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015942	GC	3	6	2573060	2573065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_015942	CA	3	6	2573089	2573094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_015942	ATC	2	6	2573400	2573405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015942	CAT	2	6	2573463	2573468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_015942	CGT	2	6	2573477	2573482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_015942	CGA	2	6	2573509	2573514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_015942	TCA	2	6	2573570	2573575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_015942	GA	3	6	2573594	2573599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015942	ATG	2	6	2573620	2573625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015942	AT	3	6	2574061	2574066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015942	ATT	2	6	2574068	2574073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015942	GAC	2	6	2574120	2574125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_015942	CG	3	6	2574213	2574218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_015942	GCC	2	6	2574294	2574299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_015942	TGAT	2	8	2575277	2575284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015942	GGCG	2	8	2575379	2575386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_015942	CTG	2	6	2575431	2575436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_015942	GTG	2	6	2575481	2575486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015942	ATA	2	6	2575503	2575508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_015942	GGC	2	6	2575604	2575609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_015942	TCA	2	6	2575614	2575619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015942	TTC	2	6	2575630	2575635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015942	GCA	2	6	2575663	2575668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015942	GC	3	6	2575708	2575713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_015942	AT	4	8	2575720	2575727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015942	AT	3	6	2575737	2575742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015942	AGG	2	6	2575750	2575755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015942	TAC	2	6	2575756	2575761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_015942	TAAT	2	8	2577906	2577913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015942	CAT	2	6	2577932	2577937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_015942	CTG	2	6	2577998	2578003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_015942	AGGC	2	8	2578235	2578242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_015942	GCC	2	6	2578300	2578305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_015942	GCT	2	6	2578357	2578362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015942	GTC	2	6	2578371	2578376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015942	TCGTA	2	10	2578382	2578391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_015942	CCA	2	6	2578449	2578454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_015942	CCG	2	6	2578467	2578472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_015942	TGA	2	6	2578481	2578486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015942	CTG	2	6	2578588	2578593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015942	ATC	2	6	2578696	2578701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_015942	CGC	2	6	2578755	2578760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_015942	ATC	2	6	2578856	2578861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_015942	CCT	2	6	2578896	2578901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_015942	TGT	2	6	2578938	2578943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015942	CCAT	2	8	2578961	2578968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_015942	CAT	2	6	2578980	2578985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_015942	CAGG	2	8	2579083	2579090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_015942	AGC	2	6	2579178	2579183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_015942	ATG	2	6	2579285	2579290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_015942	GAA	2	6	2579374	2579379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015942	AGG	2	6	2579385	2579390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015942	GCT	2	6	2579425	2579430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_015942	TGG	2	6	2579434	2579439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015942	GCA	2	6	2579446	2579451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_015942	GTG	2	6	2579480	2579485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_015942	TTC	2	6	2579551	2579556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_015942	CCA	2	6	2579719	2579724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_015942	ACAA	2	8	2579744	2579751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_015942	GCA	2	6	2579811	2579816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015942	GGC	2	6	2579881	2579886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015942	CGC	3	9	2579913	2579921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_015942	CGA	2	6	2579936	2579941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_015942	CG	3	6	2580717	2580722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_015942	CT	3	6	2583861	2583866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_015942	TA	3	6	2583868	2583873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015942	TCG	2	6	2584024	2584029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_015942	CGC	2	6	2584097	2584102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_015942	CGTCC	2	10	2584183	2584192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6094	NC_015942	G	6	6	2585095	2585100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015942	C	6	6	2585107	2585112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6096	NC_015942	GTA	2	6	2586487	2586492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015942	CCT	2	6	2586516	2586521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_015942	GGACA	2	10	2586547	2586556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_015942	CAT	2	6	2587558	2587563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015942	TGA	2	6	2587623	2587628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015942	TCA	2	6	2587841	2587846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015942	T	6	6	2589277	2589282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015942	GTC	2	6	2589349	2589354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_015942	GTG	2	6	2589392	2589397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015942	TTG	2	6	2589401	2589406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015942	CGC	2	6	2590264	2590269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_015942	ATC	2	6	2590304	2590309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_015942	AGG	2	6	2590397	2590402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015942	CTG	2	6	2590429	2590434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015942	TGA	2	6	2590497	2590502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015942	ACATAA	3	18	2590630	2590647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6112	NC_015942	AC	3	6	2590706	2590711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_015942	ACC	2	6	2590741	2590746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015942	TTG	2	6	2592605	2592610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015942	AAACAG	2	12	2592644	2592655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6116	NC_015942	TGGCA	2	10	2592671	2592680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6117	NC_015942	GAA	2	6	2592836	2592841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015942	TG	3	6	2592843	2592848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015942	CAGA	2	8	2592963	2592970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_015942	CCCG	2	8	2592971	2592978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_015942	GTC	2	6	2593067	2593072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_015942	CCAT	2	8	2593495	2593502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_015942	GTA	2	6	2593601	2593606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015942	CAT	2	6	2594388	2594393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015942	GCC	2	6	2594411	2594416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6126	NC_015942	CCG	2	6	2594509	2594514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_015942	CACC	2	8	2594553	2594560	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6128	NC_015942	GAA	2	6	2594930	2594935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015942	ATCT	2	8	2594936	2594943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_015942	GGGC	2	8	2595324	2595331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6261	NC_015942	TCAC	2	8	2639833	2639840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_015942	TCC	2	6	2639844	2639849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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